Diversity, taxonomy and phylogeny of amoebae of the family Thecamoebidae (Amoebozoa)

Abstract

Разнообразие, систематика и филогения амёб семейства Thecamoebidae (Amoebozoa) Амёбы семейства Thecamoebidae широко распространены в окружающей среде. Эти организмы сравнительно легко изолируются и культивируются, также встречаемость видов сильно различается. Есть часто встречающиеся виды, такие как Thecamoeba quadrilineata, T. similis, T. orbis; также имеются несколько видов известных по небольшому количеству работ и которые ни разу не были реизолированными с момента первого описания. Множество видов описано с помощью световой микроскопии, гораздо меньше работ с использованием современных методов электронной микроскопии и молекулярных методов (особенно это касается центрального родаThecamoeba и родов Pseudothecamoeba и Thecochaos, положение которых в системе остается неясным). Наше исследование показало, что точками высокого биоразнообразия для текамёб являются наземные местообитания – почва, трава, листовой опад, кора деревьев. Нами было выделено 33 штамма текамеб, содержащие около 10 уникальных видов из разных географических точек. Некоторые можно определить как известные виды (Thecamoeba aesculea, T. similis и T. quadrilineata), однако есть несколько штаммов, которые возможно являются новыми для науки видами. Анализ гена 18s рРНК показал наличие двух, ранее не описанных, ветвей внутри рода Thecamoeba, которые также имеют и морфологическое обоснование. Первая группа включает амёб с единственным центральным ядрышком (например, T. quadrilineata и T. aesculea), амёбы с множественными периферически расположенными ядрышками (T. similis)входят в состав второй группы. Биоразнообразие амёб рода Thecamoeba остается существенно недоисследованным, на что указывают результаты нашей работы.

Diversity, taxonomy and phylogeny of amoebae of the family Thecamoebidae (Amoebozoa) Amoebae of the family Thecamoebidae are widely distributed in the environment. These organism are relatively easy to isolate and cultivate, also the frequency of occurrence of species is very different. There are rather common species like Thecamoeba quadrilineata, T. striata and T. orbis as well as numerous species known from few findings or never re-isolated since initial description. Many of these species were studied only at the light-microscopic level and require investigation with modern methods, including electron microscopy and molecular data (this especially concerns the genus Thecamoeba and genera of unclear systematic position like Pseudothecamoeba and Thecochaos). Our studies show that “hotspot” of Thecamoeba diversity is terrestrial habitats – soil, grass, dry leaves and surface of trees. During our studies we isolated 33 strains of Thecamoeba, including approximately 10 unique species from different geographic points. Some were identified as known species (Thecamoeba aesculea, T. similis and T. quadrilineata), but there are some strains, which are perhaps new for science. The 18s rRNA genes analyse show two new branch inside Thecamoeba; which have a morphological rationale too. First group include amoebae with one large central nucleolus (likes T. quadrilineata and T. aesculea) and many peripheral nucleoluses (likes T. similis) are had amoebae from second group. Our data show that species diversity of thecamoebid amoebae remains considerably underexplored.