Algorithms for detection of non-standard amino acids in peptide antibiotics

Abstract

В данной работе мы разработали и реализовали алгоритм de novo секвенирования пептидов с учетом посттрансляционных модификаций и возможного присутствия нестандартных аминокислот путем формирования алфавита разностей масс, протестировали его и предложили возможные улучшения.

Within this work, we developed and implemented an algorithm for de novo sequencing of peptides accounting for post-translational modifications and possible presence of non-standard amino acids through formation of an alphabet of mass differences, tested it and suggested potential improvements.