Optimization of in silico HLA-typing methods for the "Russian Genomes" project

Abstract

Главный комплекс гистосовместимости человека (ГКГС) или человеческие лейкоцитарные антигены - это комплекс трансмембранных белков, являющийся ключевым в распознавании чужеродных молекул и формировании иммунного ответа. Задача генотипирования по аллелям генов ГКГС является важным этапом диагностики заболеваний, трансплантации органов и поиска новых локусов, сцепленных с заболеваниями. Представленная работа сосредоточена на оптимизации методов генотипирования по аллелям ГКГС методами in silico.

The main human histocompatibility complex (MHC) or human leukocyte antigens (HLA) is a complex of transmembrane proteins, which is the key to the recognition of foreign molecules and the formation of immune response. The task HLA-typing is an important stage in the diagnosis of diseases, organ transplantation and search for new locuses linked to diseases. The presented work is focused on the optimization of HLA-typing in silico methods.