Identification of proteins that interact with telomeric sequences in DNA and RNA

Abstract

Теломеры - это нуклеопротеиновые комплексы, которые обеспечивают защиту концевых участков линейных хромосом эукариот от систем репарации ДНК, играя важную роль в обеспечении стабильности генома. У большинства организмов теломерная ДНK представлена гуанин-богатыми тандемными повторами. В геномах многих организмов обнаруживаются так называемые интерстициальные теломерные последовательности (от английского interstitial telomeric repeats, ITSs), располагающиеся на значительном расстоянии от концевых участков. Зачастую ITSs ассоциированы с областями с повышенной геномной нестабильностью. Теломерные последовательности на концах и во внутренних сайтах хромосом вовлечены в ряд регуляторных взаимодействий, которые вносят вклад в обеспечение стабильности и нормального функционирования генома. Изучение функций теломерных последовательностей является непростой задачей, поэтому многие детали их функционирования остаются малоизученными. Использование более простых по сравнению с моделями высших эукариот и удобных для генетических манипуляций дрожжевых моделей помогает в исследовании функций теломерных последовательностей в геноме. В данной работе представлена разработка методов выделения и идентификации белков, взаимодействующих с теломерными последовательностями в ДНК и РНК, основанные на использовании дрожжевой модели S. cerevisiae.

Telomeres represent nucleoprotein complexes at the physical ends of eukaryotic linear chromosomes. Telomeres provide protection of chromosomal ends from cellular repair and recombination systems. In most organisms telomeric DNA consist of guanine-rich tandem repeats. Many eukaryotic genomes contain interstitial telomeric sequences (ITSs) within chromosomes far from their ends. ITSs are often associated with increased genomic instability. Telomeric sequences at the ends and internal sites of chromosomes are involved in range of regulatory interactions that contribute to the stability and normal genome functions. However, studying the functions of telomeric sequences is challenging, therefore many details of these processes remain poorly understood. The usage of the convenient yeast model helps in the investigation of the functions of telomeric sequences in the genome. This work presents the development of the techniques for the isolation and identification of proteins interacting with telomeric sequences in DNA and RNA based on the usage of the yeast S. cerevisiae model.