Отзыв научного руководителя Аксеновой Анны Юрьевны (к.б.н.) о выпускной квалификационной работе магистра Кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ Анастасии Александровны Данчуровой «Идентификация белков, взаимодействующих с теломерными последовательностями в ДНК и РНК.» Выпускная квалификационная работа (ВКР) магистра А. А. Данчуровой выполнена на базе научной лаборатории Биологии Амилоидов СПбГУ и ресурсного центра «Развитие молекулярных и клеточных технологий» СПбГУ. Тема работы посвящена разработке и оптимизации методов направленных на идентификацию белков, взаимодействующих с теломерными последовательностями в РНК и в ДНК. Актуальность темы работы обусловлена тем, что теломерные повторы являются основополагающей частью теломер. Теломеры являются одними из самых «горячих» и «динамичных» участков генома эукариот. Они представляют собой сложные нуклеопротеиновые комплексы, находящиеся на концах хромосом и предназначенные для их защиты от рекомбинации и перестроек. Стабильность генома в высокой степени зависит от функции выполняемой теломерами. От длины и структуры теломер зависят пролиферативный потенциал клеток и продолжительность жизни, а также риск развития онкологических заболеваний. В последние годы накапливается все больше данных о ключевой роли, выполняемой хроматином в регуляции структуры и длины теломерных трактов. Обсуждается важная роль, которую могут играть в этом процессе специфические белки, взаимодействующие с теломерными трактами в ДНК и в РНК. Именно поэтому выполненная работа имеет несомненную теоретическую и практическую значимость. Исследования, выполненные автором ВКР, проведены с использованием удобного для поставленных молекулярно-биологических задач модельного объекта – дрожжах Saccharomyces cerevisiae. Работа представлена на 62 страницах машинописного текста и состоит из традиционных разделов и списка литературы, включающего 140 ссылок. В работе использована современная литература, цитируются работы ведущих ученых, занимающихся проблемами теломер и интерстициальных теломерных последовательностей. В теоретической части («Обзор литературы») автор представляет обзор современных данных о структуре и функции теломер, а также интерстициальных теломерных последовательностей. В обзоре литературы в том числе обсуждаются литературные данные, касающиеся таких аспектов, как особенности репликации теломерных областей и особенности структуры хроматина теломерных областей, транскрипционная активность теломерных областей и транскрипция особых теломерных РНК TERRA. В целом, обзор литературы производит хорошее впечатление и дает достаточно полное представление о предмете изучения. Методическая и практическая части работы выполнены с учетом самых передовых достижений науки. В работе использована высокотехнологичная приборная база ресурсного центра «Развитие молекулярных и клеточных технологий» СПбГУ. В частности, в работе использовались: нанопоточная модульная система Dionex NanoFlow UltiMate 3000 предназначенная для высокоэффективной жидкостной хроматографии с полным электронным контролем всех параметров, роботизированный комплекс пробоподготовки LC-MALDI (ВЭЖХ-МАЛДИ) Bruker Proteineer fc II, масс-спектрометр Bruker Ultraflextreme с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (МАЛДИ, MALDI) и хроматографическая FPLC система NGC Discover 10 (Bio-Rad). Разработанные в ходе выполнения ВКР методы и подходы являются новыми и заслуживают высокой оценки. Результаты, полученные в ходе выполнения работы, представляют значительный интерес для области исследований теломер и теломерных повторов. Работа хорошо иллюстрирована, содержит 19 рисунков и 3 таблицы. В работе также представлен биоинформатический анализ одного из выявленных белков, который был выполнен автором ВКР самостоятельно. В разделе «Обсуждение» проведено сопоставление разработанных и оптимизированных с участием автора методов с существующими протеомными методами, используемыми в различных лабораториях в мире. Обсуждена значимость полученных результатов. Выводы работы соответствуют заявленной цели работы и поставленным задачам. Выпускная квалификационная работа магистра А.А. Данчуровой представляет собой комплексное и завершенное исследование. ВКР магистра А.А. Данчуровой полностью соответствует требованиям, которые предъявляются к магистерским диссертациям, выполняемым по завершении освоения образовательных программ по направлению «Биология», и заслуживает положительной оценки.