Development of a method for deconvolution of tandem mass spectra obtained using ultraviolet photodissociation

Abstract

Масс-спектрометрия --- это способ идентификации и анализа белков и пептидов. Одним из шагов обработки масс-спектров является их деконволюция. Среди алгоритмов деконволюции можно выделить комбинаторный алгоритм MS-Deconv, предназначенный для обработки top-down масс-спектров высокого разрешения. Мы разработали свой алгоритм на основе MS-Deconv, который можно применять для работы с bottom-up масс-спектрами высокого и сверхвысокого разрешения, и сравнили результаты его работы с результатами MS-Deconv.

Mass spectrometry is a technique used for identification and analysis of proteins and peptides. Prior to interpretation, acquired mass spectra are sometimes deconvoluted. MS-Deconv is a combinatorial algorithm used for deconvolution of high resolution mass spectra. We propose our own algorithm based on MS-Deconv. Its intended use is processing high and ultra high resolution bottom-up mass spectra. We also compare the performance of the new algorithm to one of MS-Deconv.