Game-theoretic modelling in genetics

Abstract

Целью этой работы является решение проблемы ранжирования генов относительно их значимости при процессе зарождения и развития генетического заболевания, в частности, болезни Альцгеймера. В качестве биологического значения индекса значимости, используемого для определения «силы» генов, рассмотрены модифицированные вектор Шепли и индекс Банзафа. Проанализированы базы данных генов пациентов с диагнозом «болезнь Альцгеймера», а также пациентов с другими видами деменции. Выявлены гены с высоким индексом «активности», которые могут играть ключевую роль при патогенезе болезни Альцгеймера. Влияние некоторых полученных генов подтверждено современными научными публикациями. Кроме того, выявлены гены, влияние которых еще не рассматривалось.

The aim of this work is to solve the problem of the ranking of genes relative to their importance in the process of nucleation and development of a genetic disease, in particular, Alzheimer's disease. As a biological value of the relevance index used to determine the "power" of genes modified Shapley vector and Bansaf index are considered. Analyzed gene databases of patients with a diagnosis of Alzheimer's disease, as well as patients with other types of dementia. Identified genes with a high index of "activity", which can play a key role in the pathogenesis of Alzheimer's disease. The influence of some of the genes obtained is confirmed by modern scientific publications. In addition, genes have been identified, the influence of which has not yet been considered.