Using coalitional games to measure power of genes

Abstract

В данной работе рассматривается приложение коалиционной теории игр к анализу экспрессии генов. Определены понятия микрочиповой игры, матрицы анормальной экспрессии, индекса значимости генов, партнерства генов, представлена аксиоматическая характеристика решений кооперативной теории игр в контексте микрочиповых игр, рассмотрен практический пример на основе изучения влияния генов на развитие болезни Паркинсона. Также была реализована программа по подсчету вектора Шепли, индекса Банзафа и ранга генов, которая позволяет наглядно показать результаты применения данного отдела теории игр к исследованию силы генов.

In this thesis the aplication of coalition game theory to gene expression analysis is observed. The definition of microarray games, expression matrix, relevance index of genes and partnership of genes are presented. An axiomatic characterization of the solutions of cooperative game theory in the context of microarray games and a practical example based on the study of the influence of genes to the pathogenesis of Parkinson's disease are considered. The programm for calculating the Shapley value and Banzhaf index was also realised.