Developing bioinformatics analysis algorithm of pathogenic microorganisms identification

Abstract

Анализ таксономической является важной частью анализа метагеномных образцов. Хотя такие алгоритмы, как BWA и BLAST, основанные на выравниваниях, способны производить точную таксономическую идентификацию, вычислительная стоимость их применения становится непреодолимой при применении их к метагеномным данным. В данной работе предлагается алгоритм быстрой и точной таксономической классификации патогенных микроорганизмов.

Metagenomic binning is an important part of metagenomic sequence analysis. Although BWA or BLAST sequence alignment algorithms can provide accurate binning results, the computational cost of such methods becomes insurmountable because of the size of metagenomic data. Novel algorithm of taxonomic classification of pathogenic microorganisms is introduced in this study and is capable of fast and accurate identification of pathogenicity of a sample.