РЕЦЕНЗИЯ на выпускную квалификационную работу Бебякова Александра Михайловича «Разработка алгоритма биоинформатического анализа идентификации патогенных микроорганизмов» Работа посвящена построению алгоритма идентификации биологических последовательностей патогенных вирусов и бактерий. В ходе работы составляется база эталонных последовательностей бактерий и вирусов. На основе указанных эталонных данных осуществляется построение системы классификаторов реализующих метод машинного обучения случайных лесов. Произведен обзор методов поиска оптимальных параметров обучения элементов системы. Также в работе решается задача выбора модели извлечения признаков строковых данных. Эффективность работы реализованных алгоритмов проверена как на искусственных модельных, так и на реальных данных. Работа логически структурирована, имеется четкое описание целей и задач исследования, методов их решения. Обзор литературы позволяет оценить актуальность выбранной проблемы и вклад автора. Список литературы содержит много современных публикаций. Существенных недостатков в дипломной работе не выявлено. Актуальность работы Бебякова А. М. не вызывает сомнений. С распространением применения технологий высокопроизводительного секвенирования значительно возросли объемы анализируемых данных метагеномных исследований, что требует разработки эффективных методов анализа и хранения результатов исследований. В работе решается задача быстрой обработки данных биологических исследований, позволяющей также ускорить проведение последующих этапов анализа. Анализ работы на плагиат показал, что основные заимствования автора относятся к описанию методов классификации на основе машинного обучения, но автор предоставил ссылки на первоисточники. Недостатки квалификационной работы носят технический характер и связаны с иллюстративным оформлением исследования, что не может повлиять на положительную оценку работы. Несомненным преимуществом работы является практическая значимость. Работа удовлетворяет всем требованиям, предъявляемым к выпускным работам магистра. На основе вышесказанного считаю, что выпускная квалификационная работа Бебякова А. М. заслуживает оценки «отлично». Рецензент, Заместитель директора по инновационной работе ФБУН Санкт-Петербургский А. В. Семенов НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, доцент кафедры клинической лабораторной диагностики СЗГМУ им. И.И. Мечникова, д.б.н.